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Notiziario di informazione a cura dell'Accademia dei Georgofili

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02 marzo 2011

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Svelato il genoma della fragola

di Roberto Viola

Con la pubblicazione del genoma della fragola sulla rivista Nature Genetics si vedono realizzati gli obiettivi della vasta comunità internazionale delle Rosaceae (RosIGI, Rosaceae International Genomics Initiative), nata a metà degli anni ’90, con l’intento di sequenziare i genomi delle più rappresentative specie da frutto di questa famiglia botanica: melo, pesco e fragola.
Il congresso più importante nel campo della genetica e genomica di piante e animali (Plant and Animal Genome Conference, San Diego California) ne ha sancito alla sua 19° edizione il successo ed il plauso della comunità scientifica. Di fatto, è la prima famiglia botanica ad avere 3 genomi sequenziati, oltre a quelli del pero, del lampone e del ciliegio in arrivo presumibilmente nel corso del 2011, che consentiranno studi di genomica comparata molto approfonditi e presumibilmente fruttuosi come mai realizzati fino ad oggi.
Il genoma della fragola è il più piccolo genoma di pianta coltivata fino ad ora decodificato, con una dimensione stimata di circa 210 milioni di basi. Sono stati identificati al momento 34.809 geni nell’oltre 98% del genoma assemblato, di cui il 92% assegnato ai relativi cromosomi. Si tratta del  primo genoma portato a termine interamente con la tecnologia 454/Roche ed assemblato  de novo con un elevato grado di precisione. Di particolare interesse, si segnalano i geni coinvolti nei percorsi metabolici dei composti aromatici e altri metaboliti secondari che caratterizzano la specie, oltre che nella fragola, oggetto di miglioramento genetico nelle piante da frutto della stessa famiglia, come appunto melo e pesco. Le potenzialità che adesso si aprono al miglioramento genetico assistito dai marcatori molecolari (MAS) nonché ad applicazioni biotecnologiche sono pressoché illimitate.

(foto: archivio Georgofili)

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